Dūņu pielietošana ir terapeitisko dūņu slāņa (nogulsnes 4-6 cm, kūdra 6-8 cm) uzlikšana dažādām ķermeņa daļām atkarībā no ārsta norīkojumiem. Parasti dūņu temperatūra ir 38–42 grādi pēc Celsija. Ir vairāki dūņu pielietošanas veidi: "apkakle" (dubļu slāņa uzlikšana uz apkakles zonas), "biksītes", "zeķes", "cimdi". Dūņu terapijā ir 3 fāzes. Pirmā ir reflektora fāze, kad dūņi ietekmē ādas receptorus, un tieši caur tiem tiek ietekmēta centrālā nervu sistēma (centrālā nervu sistēma atbild par svarīgu ķermeņa dzīves procesu pašregulāciju). Otrā fāze ir neiroķīmiska, kad organismā tiek sintezētas bioloģiski aktīvās vielas, to cirkulācija asinīs. Trešā fāze ir reakcija uz terapeitisko dūņu iedarbību: uzlabojas asins piegāde dažādiem audiem un orgāniem, palielinās skābekļa asimilācija, no organisma tiek izņemti iekaisuma procesu produkti (kaitīgas vielas, toksīni) un tiek aktivizēti ķermeņa aizsardzības mehānismi. Trešā fāze ir visilgākā no visām (no 2 līdz 24 stundām). Tā kā dūņu aplikācijas pavada mazāka ķermeņa pārkaršana, mazāka slodze uz sirds un asinsvadu sistēmu, tās ir vieglāk pārnest nekā dūņu vannas.